A gép kezelésénél az elődöknél megszokott egytárcsás megoldást használja a Canon. Az exponálógomb fölött elhelyezett vezérlőtárcsa elsősorban az expozíciós értékek megváltoztatására használható. Rekesz és záridő előválasztás módban az adott funkciót változtatja, manuális módban pedig a záridőt állíthatjuk. A rekesz állítása az expozíció kompenzáció gombbal együtt lehetséges. A főbb opciók egy meghatározott funkciógomb lenyomása, majd a státusz LCD-n megjelenő lehetőségek kiválasztásával szabályozhatók a nyíl gombokkal. Az LCD monitortól jobbra találhatók a fotózás során használható kezelőszervek, míg tőle balra a képek visszanézésére alkalmas gombok. A Canon EOS 400D kezelőszervei:

Fent

(1) Felnyíló vaku: alap üzemmódokban automatikusan felpattan, kreatív módokban a bal oldalán lévő gombbal nyitható.
(2) Vakupapucs: elsősorban E-TTL vagy E-TTL II, külső rendszervakuk számára.
(3) Exponáló gomb.
(4) Fő vezérlőtárcsa: a rekesz és a záridő beállítására szolgál (a rekeszt a hátsó Av gomb nyomvatartásával állíthatjuk).
(5) Üzemkész állapot kijelzőlámpája.
(6) Módválasztó tárcsa:
(Kreatív módok)
- P: programautomatika. Minden alapbeállítás állítható, kivéve a rekesz és a záridő.
- Tv mód: záridő előválasztás. Választott záridőkhöz a gép határozza meg a szükséges rekeszt. A használható értékek: 30; 25; 20; 15; 13; 10; 8; 6; 5; 4; 3,2; 2,5; 2; 1,6; 1,3; 1; 0,8; 0,6; 0,5; 0,4; 0,3; 1/4; 1/5; 1/6; 1/8; 1/10; 1/13; 1/15; 1/20; 1/25; 1/30; 1/40; 1/50; 1/60; 1/80; 1/100; 1/125; 1/160; 1/200; 1/250; 1/320; 1/400; 1/500; 1/640; 1/800; 1/1000; 1/1300; 1/1600; 1/2000; 1/4000.
- Av mód: rekesz előválasztás. A rekeszértéket a fotós határozza meg, gép pedig - a fénymérés alapján - ehhez választ megfelelő záridő párt. A használható rekeszérték a felhelyezett objektívtől függ.
- M mód: a rekesz, és a záridő értékeit is a felhasználó határozza meg. Elérhető a B (Bulb) mód is, amely az exponáló gomb nyomvatartásának idejéig folytatja az expozíciót. Aktiválható vezetékes-, vagy infra távkioldóval is.
- A-DEP: automatikus mélységélesség kontroll. Ebben a módban a fókuszpontokat lefedő fotótémákhoz igazítja a gép a mélységélességet, ami ez esetben a megfelelő rekeszérték kiválasztását jelenti. A gép a fókuszpontokat fedő közeli és legtávolabbi témákat is a mélységélességi tartományba veszi.

(Alap módok)
- Auto: automata fényképezés. Csupán az alapfunkciók (pl. expozíció kompenzáció, érzékenység, stb) állíthatók. A fontosabb expozíciós beállításokat a gép automatikusan végzi.
-Portré mód: motívumprogram portré fényképezéshez, tág rekesszel.
-Tájkép: motívumprogram tájfotó készítéshez, szűk rekesszel.
- Közeli: a makró és közelfényképezés motívumprogramja.
- Sport: gyors mozgások fotózása, folyamatos autofókusszal.
- Éjszakai: átfogó táj és városképek gyenge fénynél, vakuval és hosszú záridőkkel
- Vaku tiltás: letiltja a külső és belső vakut (pl. múzeumi fotózásnál lehet hasznos).
(7) Ki-, és bekapcsológomb.

Hátul

(1) A kereső dioptriakorrekciós tárcsája: -3,0 - +1,0 dioptria között állítható.
(2) AE-L/FE-L gomb: felvételi üzemmódban az expozíciós vagy a vakufénymérési értékek rögzíthetők a gombbal, lejátszásnál a képnézet kicsinyítésére és az indexképes nézet bekapcsolására használható.
(3) AF mező választó: felvétel során a 9 AF mező között választhatunk, lejátszás során a képnézet max. 10x nagyítására szolgál.
(4) Av/Exp kompenzáció: Nyomva tartva és az elülső vezérlőtárcsát elfordítva állítható a rekeszérték (M módban), egyéb felvételi módokban ugyanez a gombkombináció az expozíció kompenzációt befolyásolja.
(5) Drive gomb: egyképes, sorozat és önkioldó mód választható.
(6) Négyirányú nyílgombok: a menüben való navigációra és a képek lapozására szolgálnak. További funkciók felvétel üzemmódban:
- felfelé nyíl: érzékenység állítása
- lefelé nyíl: fehéregyensúly
- bal nyíl: fénymérési mód kiválasztása
- jobb nyíl: AF mód választó
(7) SET gomb: a menüben beállított értékek véglegesítésére szolgál. A menüben egyedi funkciót rendelhetünk hozzá (pl. képminőség és méret, vaku exp. kompenzáció). Alapesetben a képstílusok beállítására szolgál.
(8) CF memória működésjelző lámpája.
(9) Print/Share: közvetlen nyomtatás és megosztás gombja.
(10) DISP.: LCD-n megjelenő információk és státuszadatok váltására használható.
(11) MENU: a menü aktiválására és kikapcsolására szolgáló gomb.
(12) JUMP: A gombot lenyomva és a fel/le nyílgombokat használva 10, 100 képenként, vagy dátum szerint lapozhatunk a rögzített fotók között.
(13) Playback gomb: lejátszás mód kapcsológombja.
(14) Erase: képtörlés gomb.

Elöl

(1) Infra távvezérlő érzékelője.
(2) Exponáló gomb.
(3) Vörösszem csökkentő és önkioldó visszaszámlálást jelző lámpa.
(4) Vaku felnyitását végző gomb.
(5) Az objektív kioldására szolgáló gomb.
(6) DOF Preview: lenyomva a beállított pozícióba ugranak a rekeszlamellák, így a keresőben ellenőrizhető a mélységélesség.