Az Olympus OM-D E-M5 Mark III új firmware-ét még november közepén jelentette be az Olympus, az E-M1 Mark II, Mark III és az E-M1X modellekkel együtt. Azóta már kiadta az Olympus a firmware frissítéseket, de az E-M5 Mark III-hoz készült frissítéssel hibák jelentkeztek, így visszavonta azt (a v1.3 már nem volt elérhető a frissítések között).
Most azonban már ehhez a géphez is letölthető a v1.4-es firmware, amely elhozza a v1.3-ba ígért hatékonyabb videóstabilizálást, valamint új objektíveket is támogat a gép a fókusz-sorozat (focus-stacking) használatánál, emellett pedig a v1.3-mal előforduló Wi-Fi kapcsolódási hibákat is korrigálták.
A frissítés letölthető az Olympus Updater szoftver segítségével, amennyiben a fényképezőgépet internet hozzáféréssel rendelkező számítógéphez kötjük USB-n keresztül.